卵巢巧克力囊肿是“肿块”但并非是“肿瘤”，它是子宫内膜异位症的一种病变。正常情况下，子宫内膜生长在子宫腔内，受体内女性激素的影响，每月脱落一次，形成月经。如果月经期脱落的子宫内膜碎片，随经血逆流经输卵管进入盆腔，种植在卵巢表面或盆腔其他部位，形成异位囊肿，这种异位的子宫内膜也受性激素的影响，随同月经周期反复脱落出血，如病变发生在卵巢上，每次月经期局部都有出血，使卵巢增大，形成内含陈旧性积血的囊肿，这种陈旧性血呈褐色，粘稠如糊状，似巧克力，故又称“巧克力囊肿”。这种囊肿可以逐渐增大，有时会在经期或经后发生破裂，但很少发生恶变。
巧克力囊肿是妇科病中最复杂的病，是最不易治疗的良性肿瘤。它到处粘连，四处流窜，治疗之后又很容易复发，缠绵难愈。无论是保守手术还是药物治疗，效果均不理想，而根治手术又不适合想要生小孩的女性。据了解，巧克力囊肿已经成为现代女性的多发病，它在大龄未生育的女性中并不少见，有人甚至认为它很可能成为这个世纪最为严重的妇女疾病之一。
巧克力囊肿除了让女性在每个经期痛苦万分之外，引起的最大麻烦就是不孕。因为它会伤害到体内的组织，如果在肠胃附近，就会造成腹泻肠胃疼痛；如果是在卵巢，就会影响到卵巢、输卵管功能，造成不孕。严重的巧克力囊肿甚至从根本上颠覆女性做母亲的天职。
巧克力囊肿的治疗原则是，对有生育要求的年轻妇女一般采用药物治疗并定期随访检查。若症状较重，经药物治疗效果不明显，或卵巢有较大包块的，可以采用保守性手术，如卵巢内膜囊肿巧克力液抽吸术，内膜囊肿剥除术或患侧卵巢切除术，以保留正常卵巢和生育功能。不过，经保守性手术后仍有可能复发。患者应坚持随访并争取尽早怀孕对40岁以上，年龄较大且无生育要求的妇女，可以切除全子宫以及一侧或双侧卵巢和输卵管。
早期症状一：不正常的经痛。痛经是子宫内膜异位最明显的症状，却是最容易忽略的先兆。
早期症状二：性变疼痛。这也是一个明显的信号，可能还伴有点状出血。
早期症状三：没有避孕也不会怀孕。在不孕的女性中，子宫内膜异位造成的不孕占有很高的比例。
在很多子宫内膜异位是B超也不一定查得出来的。医生有时可能通过内诊接触到异物，但最准确的方法还是腹腔镜的检查。用腹腔镜检查时可以顺带做处理，加上术后的药物治疗常可以痊愈。由于一般的体检往往不能查出子宫内膜异位，所以更要提高警惕。
1、女性月经期一定要杜绝性活；
2、要注意自身保暖，避免感寒着凉；
3、月经期间，禁止一切激烈体育运动及重体力劳动；
4、女孩子青春期要避免受惊吓，以免导致闭经或形成溢流；
5、月经期要做学会控制情绪，不要生闷气，否则会导致内分泌失调；
6、随时调整自己的情绪，保持乐观开朗的心态，使机体免疫系统的功能正常。
7、如果已查处患有子宫内膜异位症，卵巢巧克力囊肿大于7厘米以上者，在月经期或月经中期一定要注意保持情绪稳定，避免过度劳累。一旦囊腔内张力突然升高时，囊壁破裂，会形成急腹症。